"Expediente 39" es una película de terror protagonizada por Renée Zellweger, en el papel de la trabajadora de servicios sociales Emily Jenkins. Emily piensa que ha visto todo hasta que un día conoce a su nuevo y más misterioso caso, una problemática niña de 10 años llamada Lilith Sullivan (Jodelle Ferland). Confirma sus peores miedos cuando los padres de Lilith intentan matar a la niña, su única hija. Emily la salva y decide llevársela con ella hasta que otra familia llegue para acogerla.

Entonces, el verdadero terror comienza...